Né dans une famille de musiciens, Jean-Christophe Rouger débute le piano à l’âge de 4 ans avec une élève d’Alfred Cortot, assistante d’Yves Nat au CNSM. Tout en poursuivant une formation classique en piano au conservatoire du XVème à Paris où il obtient un 1er Prix de la Ville de Paris, il étudie l’harmonie avec Janine Rueff et le contrepoint avec Bernard de Crépy.